Protein–RNA interactions for Protein: Q96A46

SLC25A28, Mitoferrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A28Q96A46 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A28Q96A46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A28Q96A46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A28Q96A46 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A28Q96A46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A28Q96A46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A28Q96A46 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A28Q96A46 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A28Q96A46 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A28Q96A46 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A28Q96A46 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A28Q96A46 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A28Q96A46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC25A28Q96A46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A28Q96A46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A28Q96A46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A28Q96A46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A28Q96A46 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A28Q96A46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A28Q96A46 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A28Q96A46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC25A28Q96A46 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC25A28Q96A46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A28Q96A46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A28Q96A46 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A28Q96A46 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A28Q96A46 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A28Q96A46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A28Q96A46 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC25A28Q96A46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A28Q96A46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A28Q96A46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A28Q96A46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A28Q96A46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms