Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V1E2Q96A05 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V1E2Q96A05 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V1E2Q96A05 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V1E2Q96A05 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V1E2Q96A05 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP6V1E2Q96A05 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V1E2Q96A05 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP6V1E2Q96A05 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V1E2Q96A05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V1E2Q96A05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V1E2Q96A05 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V1E2Q96A05 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP6V1E2Q96A05 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V1E2Q96A05 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP6V1E2Q96A05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP6V1E2Q96A05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP6V1E2Q96A05 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP6V1E2Q96A05 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP6V1E2Q96A05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP6V1E2Q96A05 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP6V1E2Q96A05 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP6V1E2Q96A05 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP6V1E2Q96A05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP6V1E2Q96A05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP6V1E2Q96A05 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V1E2Q96A05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1E2Q96A05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1E2Q96A05 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1E2Q96A05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1E2Q96A05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1E2Q96A05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V1E2Q96A05 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP6V1E2Q96A05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP6V1E2Q96A05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP6V1E2Q96A05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP6V1E2Q96A05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP6V1E2Q96A05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP6V1E2Q96A05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP6V1E2Q96A05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP6V1E2Q96A05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP6V1E2Q96A05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms