Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CASKIN2Q8WXE0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASKIN2Q8WXE0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CASKIN2Q8WXE0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASKIN2Q8WXE0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CASKIN2Q8WXE0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CASKIN2Q8WXE0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CASKIN2Q8WXE0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASKIN2Q8WXE0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASKIN2Q8WXE0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CASKIN2Q8WXE0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASKIN2Q8WXE0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASKIN2Q8WXE0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASKIN2Q8WXE0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASKIN2Q8WXE0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASKIN2Q8WXE0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASKIN2Q8WXE0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASKIN2Q8WXE0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASKIN2Q8WXE0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASKIN2Q8WXE0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASKIN2Q8WXE0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CASKIN2Q8WXE0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASKIN2Q8WXE0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASKIN2Q8WXE0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CASKIN2Q8WXE0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CASKIN2Q8WXE0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CASKIN2Q8WXE0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CASKIN2Q8WXE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASKIN2Q8WXE0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASKIN2Q8WXE0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASKIN2Q8WXE0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASKIN2Q8WXE0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASKIN2Q8WXE0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASKIN2Q8WXE0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASKIN2Q8WXE0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASKIN2Q8WXE0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASKIN2Q8WXE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CASKIN2Q8WXE0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CASKIN2Q8WXE0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASKIN2Q8WXE0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CASKIN2Q8WXE0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CASKIN2Q8WXE0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASKIN2Q8WXE0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASKIN2Q8WXE0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASKIN2Q8WXE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASKIN2Q8WXE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASKIN2Q8WXE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASKIN2Q8WXE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASKIN2Q8WXE0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASKIN2Q8WXE0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASKIN2Q8WXE0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASKIN2Q8WXE0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASKIN2Q8WXE0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASKIN2Q8WXE0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASKIN2Q8WXE0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASKIN2Q8WXE0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CASKIN2Q8WXE0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASKIN2Q8WXE0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASKIN2Q8WXE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASKIN2Q8WXE0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms