Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CASKIN2Q8WXE0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CASKIN2Q8WXE0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CASKIN2Q8WXE0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CASKIN2Q8WXE0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CASKIN2Q8WXE0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CASKIN2Q8WXE0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN2Q8WXE0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN2Q8WXE0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN2Q8WXE0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CASKIN2Q8WXE0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN2Q8WXE0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CASKIN2Q8WXE0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CASKIN2Q8WXE0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CASKIN2Q8WXE0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CASKIN2Q8WXE0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CASKIN2Q8WXE0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASKIN2Q8WXE0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CASKIN2Q8WXE0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CASKIN2Q8WXE0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CASKIN2Q8WXE0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CASKIN2Q8WXE0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CASKIN2Q8WXE0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CASKIN2Q8WXE0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASKIN2Q8WXE0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASKIN2Q8WXE0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASKIN2Q8WXE0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CASKIN2Q8WXE0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASKIN2Q8WXE0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CASKIN2Q8WXE0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASKIN2Q8WXE0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CASKIN2Q8WXE0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CASKIN2Q8WXE0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASKIN2Q8WXE0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CASKIN2Q8WXE0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CASKIN2Q8WXE0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CASKIN2Q8WXE0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CASKIN2Q8WXE0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CASKIN2Q8WXE0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASKIN2Q8WXE0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASKIN2Q8WXE0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CASKIN2Q8WXE0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASKIN2Q8WXE0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASKIN2Q8WXE0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASKIN2Q8WXE0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASKIN2Q8WXE0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASKIN2Q8WXE0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASKIN2Q8WXE0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASKIN2Q8WXE0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CASKIN2Q8WXE0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CASKIN2Q8WXE0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CASKIN2Q8WXE0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CASKIN2Q8WXE0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CASKIN2Q8WXE0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CASKIN2Q8WXE0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CASKIN2Q8WXE0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CASKIN2Q8WXE0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CASKIN2Q8WXE0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CASKIN2Q8WXE0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CASKIN2Q8WXE0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CASKIN2Q8WXE0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CASKIN2Q8WXE0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASKIN2Q8WXE0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASKIN2Q8WXE0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASKIN2Q8WXE0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASKIN2Q8WXE0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CASKIN2Q8WXE0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASKIN2Q8WXE0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASKIN2Q8WXE0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CASKIN2Q8WXE0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CASKIN2Q8WXE0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASKIN2Q8WXE0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASKIN2Q8WXE0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASKIN2Q8WXE0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CASKIN2Q8WXE0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CASKIN2Q8WXE0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASKIN2Q8WXE0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASKIN2Q8WXE0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CASKIN2Q8WXE0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASKIN2Q8WXE0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CASKIN2Q8WXE0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CASKIN2Q8WXE0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASKIN2Q8WXE0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASKIN2Q8WXE0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASKIN2Q8WXE0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASKIN2Q8WXE0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASKIN2Q8WXE0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASKIN2Q8WXE0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CASKIN2Q8WXE0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASKIN2Q8WXE0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASKIN2Q8WXE0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASKIN2Q8WXE0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASKIN2Q8WXE0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASKIN2Q8WXE0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASKIN2Q8WXE0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASKIN2Q8WXE0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms