Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDP1

RNASEH2C, Ribonuclease H2 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH2CQ8TDP1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNASEH2CQ8TDP1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNASEH2CQ8TDP1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH2CQ8TDP1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH2CQ8TDP1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH2CQ8TDP1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH2CQ8TDP1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH2CQ8TDP1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH2CQ8TDP1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH2CQ8TDP1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH2CQ8TDP1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH2CQ8TDP1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH2CQ8TDP1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNASEH2CQ8TDP1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNASEH2CQ8TDP1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNASEH2CQ8TDP1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNASEH2CQ8TDP1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNASEH2CQ8TDP1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNASEH2CQ8TDP1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH2CQ8TDP1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH2CQ8TDP1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH2CQ8TDP1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH2CQ8TDP1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH2CQ8TDP1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH2CQ8TDP1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNASEH2CQ8TDP1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNASEH2CQ8TDP1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNASEH2CQ8TDP1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNASEH2CQ8TDP1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms