Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPATA4Q8NEY3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPATA4Q8NEY3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SPATA4Q8NEY3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPATA4Q8NEY3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SPATA4Q8NEY3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SPATA4Q8NEY3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPATA4Q8NEY3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SPATA4Q8NEY3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPATA4Q8NEY3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPATA4Q8NEY3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPATA4Q8NEY3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SPATA4Q8NEY3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPATA4Q8NEY3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPATA4Q8NEY3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPATA4Q8NEY3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPATA4Q8NEY3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPATA4Q8NEY3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPATA4Q8NEY3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPATA4Q8NEY3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPATA4Q8NEY3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPATA4Q8NEY3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPATA4Q8NEY3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPATA4Q8NEY3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPATA4Q8NEY3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPATA4Q8NEY3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPATA4Q8NEY3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA4Q8NEY3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPATA4Q8NEY3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA4Q8NEY3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPATA4Q8NEY3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPATA4Q8NEY3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPATA4Q8NEY3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPATA4Q8NEY3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPATA4Q8NEY3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SPATA4Q8NEY3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPATA4Q8NEY3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SPATA4Q8NEY3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPATA4Q8NEY3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPATA4Q8NEY3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPATA4Q8NEY3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPATA4Q8NEY3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPATA4Q8NEY3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPATA4Q8NEY3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPATA4Q8NEY3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPATA4Q8NEY3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA4Q8NEY3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPATA4Q8NEY3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPATA4Q8NEY3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms