Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC112Q8NEF3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC112Q8NEF3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC112Q8NEF3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC112Q8NEF3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC112Q8NEF3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC112Q8NEF3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC112Q8NEF3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC112Q8NEF3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC112Q8NEF3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC112Q8NEF3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC112Q8NEF3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC112Q8NEF3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC112Q8NEF3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC112Q8NEF3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC112Q8NEF3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC112Q8NEF3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC112Q8NEF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC112Q8NEF3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC112Q8NEF3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC112Q8NEF3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC112Q8NEF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC112Q8NEF3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC112Q8NEF3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC112Q8NEF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC112Q8NEF3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC112Q8NEF3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC112Q8NEF3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC112Q8NEF3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC112Q8NEF3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC112Q8NEF3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC112Q8NEF3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC112Q8NEF3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC112Q8NEF3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC112Q8NEF3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC112Q8NEF3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC112Q8NEF3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC112Q8NEF3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC112Q8NEF3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC112Q8NEF3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC112Q8NEF3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC112Q8NEF3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC112Q8NEF3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC112Q8NEF3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC112Q8NEF3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC112Q8NEF3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC112Q8NEF3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC112Q8NEF3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC112Q8NEF3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC112Q8NEF3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC112Q8NEF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC112Q8NEF3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC112Q8NEF3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC112Q8NEF3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC112Q8NEF3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC112Q8NEF3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC112Q8NEF3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC112Q8NEF3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC112Q8NEF3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC112Q8NEF3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC112Q8NEF3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC112Q8NEF3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC112Q8NEF3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC112Q8NEF3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC112Q8NEF3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC112Q8NEF3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC112Q8NEF3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC112Q8NEF3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC112Q8NEF3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC112Q8NEF3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC112Q8NEF3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC112Q8NEF3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC112Q8NEF3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC112Q8NEF3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC112Q8NEF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC112Q8NEF3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC112Q8NEF3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC112Q8NEF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms