Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SPRYD3Q8NCJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SPRYD3Q8NCJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SPRYD3Q8NCJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SPRYD3Q8NCJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SPRYD3Q8NCJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SPRYD3Q8NCJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SPRYD3Q8NCJ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SPRYD3Q8NCJ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SPRYD3Q8NCJ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SPRYD3Q8NCJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SPRYD3Q8NCJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SPRYD3Q8NCJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SPRYD3Q8NCJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SPRYD3Q8NCJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SPRYD3Q8NCJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPRYD3Q8NCJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPRYD3Q8NCJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SPRYD3Q8NCJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPRYD3Q8NCJ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPRYD3Q8NCJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPRYD3Q8NCJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPRYD3Q8NCJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPRYD3Q8NCJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPRYD3Q8NCJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPRYD3Q8NCJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPRYD3Q8NCJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPRYD3Q8NCJ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPRYD3Q8NCJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPRYD3Q8NCJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPRYD3Q8NCJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPRYD3Q8NCJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPRYD3Q8NCJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPRYD3Q8NCJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPRYD3Q8NCJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPRYD3Q8NCJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPRYD3Q8NCJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPRYD3Q8NCJ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SPRYD3Q8NCJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPRYD3Q8NCJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPRYD3Q8NCJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPRYD3Q8NCJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPRYD3Q8NCJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPRYD3Q8NCJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SPRYD3Q8NCJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SPRYD3Q8NCJ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPRYD3Q8NCJ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SPRYD3Q8NCJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SPRYD3Q8NCJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SPRYD3Q8NCJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SPRYD3Q8NCJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SPRYD3Q8NCJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SPRYD3Q8NCJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SPRYD3Q8NCJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SPRYD3Q8NCJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPRYD3Q8NCJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPRYD3Q8NCJ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms