Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SPRYD3Q8NCJ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SPRYD3Q8NCJ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SPRYD3Q8NCJ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SPRYD3Q8NCJ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SPRYD3Q8NCJ5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SPRYD3Q8NCJ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
SPRYD3Q8NCJ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SPRYD3Q8NCJ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SPRYD3Q8NCJ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SPRYD3Q8NCJ5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SPRYD3Q8NCJ5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SPRYD3Q8NCJ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SPRYD3Q8NCJ5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SPRYD3Q8NCJ5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SPRYD3Q8NCJ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SPRYD3Q8NCJ5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPRYD3Q8NCJ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPRYD3Q8NCJ5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPRYD3Q8NCJ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SPRYD3Q8NCJ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPRYD3Q8NCJ5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SPRYD3Q8NCJ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SPRYD3Q8NCJ5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPRYD3Q8NCJ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPRYD3Q8NCJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPRYD3Q8NCJ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SPRYD3Q8NCJ5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SPRYD3Q8NCJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SPRYD3Q8NCJ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SPRYD3Q8NCJ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPRYD3Q8NCJ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SPRYD3Q8NCJ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SPRYD3Q8NCJ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPRYD3Q8NCJ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPRYD3Q8NCJ5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SPRYD3Q8NCJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SPRYD3Q8NCJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPRYD3Q8NCJ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SPRYD3Q8NCJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SPRYD3Q8NCJ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SPRYD3Q8NCJ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPRYD3Q8NCJ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SPRYD3Q8NCJ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SPRYD3Q8NCJ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SPRYD3Q8NCJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SPRYD3Q8NCJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SPRYD3Q8NCJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SPRYD3Q8NCJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SPRYD3Q8NCJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SPRYD3Q8NCJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SPRYD3Q8NCJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SPRYD3Q8NCJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SPRYD3Q8NCJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SPRYD3Q8NCJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SPRYD3Q8NCJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SPRYD3Q8NCJ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SPRYD3Q8NCJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SPRYD3Q8NCJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SPRYD3Q8NCJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SPRYD3Q8NCJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SPRYD3Q8NCJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SPRYD3Q8NCJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SPRYD3Q8NCJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SPRYD3Q8NCJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SPRYD3Q8NCJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SPRYD3Q8NCJ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SPRYD3Q8NCJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SPRYD3Q8NCJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SPRYD3Q8NCJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SPRYD3Q8NCJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms