Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SARM1Q6SZW1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SARM1Q6SZW1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SARM1Q6SZW1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SARM1Q6SZW1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SARM1Q6SZW1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SARM1Q6SZW1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SARM1Q6SZW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SARM1Q6SZW1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SARM1Q6SZW1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SARM1Q6SZW1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SARM1Q6SZW1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SARM1Q6SZW1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SARM1Q6SZW1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SARM1Q6SZW1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SARM1Q6SZW1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SARM1Q6SZW1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SARM1Q6SZW1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SARM1Q6SZW1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SARM1Q6SZW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SARM1Q6SZW1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SARM1Q6SZW1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SARM1Q6SZW1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SARM1Q6SZW1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SARM1Q6SZW1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SARM1Q6SZW1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SARM1Q6SZW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SARM1Q6SZW1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SARM1Q6SZW1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SARM1Q6SZW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SARM1Q6SZW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SARM1Q6SZW1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SARM1Q6SZW1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SARM1Q6SZW1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SARM1Q6SZW1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SARM1Q6SZW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SARM1Q6SZW1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SARM1Q6SZW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SARM1Q6SZW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SARM1Q6SZW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SARM1Q6SZW1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SARM1Q6SZW1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SARM1Q6SZW1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SARM1Q6SZW1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SARM1Q6SZW1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SARM1Q6SZW1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SARM1Q6SZW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SARM1Q6SZW1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SARM1Q6SZW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SARM1Q6SZW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SARM1Q6SZW1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SARM1Q6SZW1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SARM1Q6SZW1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SARM1Q6SZW1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SARM1Q6SZW1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SARM1Q6SZW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SARM1Q6SZW1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SARM1Q6SZW1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SARM1Q6SZW1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SARM1Q6SZW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SARM1Q6SZW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SARM1Q6SZW1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SARM1Q6SZW1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SARM1Q6SZW1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SARM1Q6SZW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SARM1Q6SZW1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SARM1Q6SZW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SARM1Q6SZW1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SARM1Q6SZW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SARM1Q6SZW1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SARM1Q6SZW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SARM1Q6SZW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SARM1Q6SZW1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SARM1Q6SZW1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SARM1Q6SZW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SARM1Q6SZW1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SARM1Q6SZW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SARM1Q6SZW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SARM1Q6SZW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SARM1Q6SZW1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms