Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAAP20Q6NZ36 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAAP20Q6NZ36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAAP20Q6NZ36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAAP20Q6NZ36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAAP20Q6NZ36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAAP20Q6NZ36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAAP20Q6NZ36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAAP20Q6NZ36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAAP20Q6NZ36 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAAP20Q6NZ36 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAAP20Q6NZ36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAAP20Q6NZ36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAAP20Q6NZ36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAAP20Q6NZ36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAAP20Q6NZ36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAAP20Q6NZ36 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAAP20Q6NZ36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAAP20Q6NZ36 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAAP20Q6NZ36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAAP20Q6NZ36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAAP20Q6NZ36 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAAP20Q6NZ36 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAAP20Q6NZ36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAAP20Q6NZ36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAAP20Q6NZ36 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAAP20Q6NZ36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAAP20Q6NZ36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAAP20Q6NZ36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAAP20Q6NZ36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAAP20Q6NZ36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAAP20Q6NZ36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAAP20Q6NZ36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAAP20Q6NZ36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAAP20Q6NZ36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAAP20Q6NZ36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAAP20Q6NZ36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAAP20Q6NZ36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAAP20Q6NZ36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAAP20Q6NZ36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAAP20Q6NZ36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAAP20Q6NZ36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAAP20Q6NZ36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAAP20Q6NZ36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAAP20Q6NZ36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAAP20Q6NZ36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAAP20Q6NZ36 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms