Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALS2CLQ60I27 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2CLQ60I27 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2CLQ60I27 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2CLQ60I27 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2CLQ60I27 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2CLQ60I27 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2CLQ60I27 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALS2CLQ60I27 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2CLQ60I27 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2CLQ60I27 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALS2CLQ60I27 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2CLQ60I27 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2CLQ60I27 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2CLQ60I27 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2CLQ60I27 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALS2CLQ60I27 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ALS2CLQ60I27 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2CLQ60I27 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2CLQ60I27 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2CLQ60I27 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2CLQ60I27 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2CLQ60I27 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2CLQ60I27 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALS2CLQ60I27 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2CLQ60I27 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALS2CLQ60I27 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALS2CLQ60I27 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALS2CLQ60I27 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALS2CLQ60I27 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2CLQ60I27 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALS2CLQ60I27 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALS2CLQ60I27 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2CLQ60I27 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2CLQ60I27 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2CLQ60I27 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2CLQ60I27 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ALS2CLQ60I27 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2CLQ60I27 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2CLQ60I27 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2CLQ60I27 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2CLQ60I27 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALS2CLQ60I27 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2CLQ60I27 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALS2CLQ60I27 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2CLQ60I27 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2CLQ60I27 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2CLQ60I27 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALS2CLQ60I27 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALS2CLQ60I27 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2CLQ60I27 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2CLQ60I27 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2CLQ60I27 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2CLQ60I27 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2CLQ60I27 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ALS2CLQ60I27 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2CLQ60I27 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2CLQ60I27 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2CLQ60I27 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2CLQ60I27 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2CLQ60I27 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2CLQ60I27 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2CLQ60I27 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2CLQ60I27 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2CLQ60I27 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2CLQ60I27 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2CLQ60I27 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALS2CLQ60I27 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2CLQ60I27 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2CLQ60I27 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2CLQ60I27 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2CLQ60I27 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2CLQ60I27 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2CLQ60I27 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2CLQ60I27 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms