Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC38Q502W7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC38Q502W7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC38Q502W7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC38Q502W7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC38Q502W7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC38Q502W7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC38Q502W7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC38Q502W7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC38Q502W7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC38Q502W7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC38Q502W7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC38Q502W7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC38Q502W7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC38Q502W7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC38Q502W7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC38Q502W7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC38Q502W7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC38Q502W7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC38Q502W7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC38Q502W7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC38Q502W7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC38Q502W7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC38Q502W7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC38Q502W7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC38Q502W7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC38Q502W7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC38Q502W7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC38Q502W7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC38Q502W7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC38Q502W7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC38Q502W7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC38Q502W7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC38Q502W7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC38Q502W7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC38Q502W7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC38Q502W7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC38Q502W7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC38Q502W7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC38Q502W7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC38Q502W7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC38Q502W7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC38Q502W7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC38Q502W7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC38Q502W7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC38Q502W7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC38Q502W7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC38Q502W7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC38Q502W7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC38Q502W7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC38Q502W7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC38Q502W7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC38Q502W7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC38Q502W7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC38Q502W7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC38Q502W7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC38Q502W7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms