Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF56Q15929 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF56Q15929 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF56Q15929 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF56Q15929 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF56Q15929 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF56Q15929 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF56Q15929 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF56Q15929 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF56Q15929 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF56Q15929 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF56Q15929 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF56Q15929 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF56Q15929 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF56Q15929 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF56Q15929 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF56Q15929 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF56Q15929 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF56Q15929 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF56Q15929 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF56Q15929 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF56Q15929 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF56Q15929 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF56Q15929 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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