Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWIST1Q15672 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST1Q15672 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST1Q15672 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST1Q15672 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST1Q15672 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms