Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGN3Q15651 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGN3Q15651 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGN3Q15651 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGN3Q15651 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGN3Q15651 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGN3Q15651 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGN3Q15651 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGN3Q15651 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGN3Q15651 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGN3Q15651 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGN3Q15651 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGN3Q15651 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGN3Q15651 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGN3Q15651 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGN3Q15651 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN3Q15651 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN3Q15651 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGN3Q15651 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN3Q15651 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN3Q15651 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN3Q15651 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN3Q15651 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGN3Q15651 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN3Q15651 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN3Q15651 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGN3Q15651 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGN3Q15651 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN3Q15651 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN3Q15651 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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