Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC3Q15034 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC3Q15034 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC3Q15034 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC3Q15034 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC3Q15034 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC3Q15034 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC3Q15034 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC3Q15034 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC3Q15034 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC3Q15034 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC3Q15034 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC3Q15034 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC3Q15034 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC3Q15034 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC3Q15034 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC3Q15034 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC3Q15034 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC3Q15034 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC3Q15034 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC3Q15034 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC3Q15034 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC3Q15034 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC3Q15034 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC3Q15034 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC3Q15034 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC3Q15034 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC3Q15034 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC3Q15034 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC3Q15034 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC3Q15034 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC3Q15034 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC3Q15034 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC3Q15034 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC3Q15034 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC3Q15034 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC3Q15034 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC3Q15034 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC3Q15034 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC3Q15034 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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