Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF1Q14990 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF1Q14990 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF1Q14990 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF1Q14990 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF1Q14990 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF1Q14990 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF1Q14990 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF1Q14990 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF1Q14990 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF1Q14990 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF1Q14990 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF1Q14990 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF1Q14990 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF1Q14990 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF1Q14990 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF1Q14990 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF1Q14990 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF1Q14990 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF1Q14990 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF1Q14990 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF1Q14990 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF1Q14990 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ODF1Q14990 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF1Q14990 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF1Q14990 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF1Q14990 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF1Q14990 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF1Q14990 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF1Q14990 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF1Q14990 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF1Q14990 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF1Q14990 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF1Q14990 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF1Q14990 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF1Q14990 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF1Q14990 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF1Q14990 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF1Q14990 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF1Q14990 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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