Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRR1Q13601 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRR1Q13601 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRR1Q13601 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRR1Q13601 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRR1Q13601 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRR1Q13601 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRR1Q13601 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRR1Q13601 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRR1Q13601 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRR1Q13601 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRR1Q13601 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRR1Q13601 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRR1Q13601 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRR1Q13601 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRR1Q13601 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRR1Q13601 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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