Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KRR1Q13601 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRR1Q13601 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRR1Q13601 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRR1Q13601 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KRR1Q13601 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRR1Q13601 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRR1Q13601 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRR1Q13601 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRR1Q13601 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRR1Q13601 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRR1Q13601 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRR1Q13601 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRR1Q13601 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRR1Q13601 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRR1Q13601 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRR1Q13601 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRR1Q13601 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRR1Q13601 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRR1Q13601 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRR1Q13601 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRR1Q13601 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRR1Q13601 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRR1Q13601 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRR1Q13601 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRR1Q13601 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRR1Q13601 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRR1Q13601 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRR1Q13601 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRR1Q13601 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRR1Q13601 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRR1Q13601 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRR1Q13601 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRR1Q13601 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRR1Q13601 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRR1Q13601 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRR1Q13601 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRR1Q13601 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRR1Q13601 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRR1Q13601 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRR1Q13601 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRR1Q13601 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRR1Q13601 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRR1Q13601 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRR1Q13601 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRR1Q13601 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRR1Q13601 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRR1Q13601 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRR1Q13601 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRR1Q13601 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRR1Q13601 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRR1Q13601 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRR1Q13601 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRR1Q13601 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRR1Q13601 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRR1Q13601 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRR1Q13601 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRR1Q13601 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRR1Q13601 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRR1Q13601 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRR1Q13601 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRR1Q13601 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRR1Q13601 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRR1Q13601 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRR1Q13601 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRR1Q13601 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRR1Q13601 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRR1Q13601 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRR1Q13601 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRR1Q13601 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRR1Q13601 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRR1Q13601 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRR1Q13601 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRR1Q13601 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRR1Q13601 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRR1Q13601 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRR1Q13601 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRR1Q13601 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRR1Q13601 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRR1Q13601 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRR1Q13601 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRR1Q13601 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRR1Q13601 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRR1Q13601 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRR1Q13601 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRR1Q13601 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRR1Q13601 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRR1Q13601 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRR1Q13601 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRR1Q13601 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRR1Q13601 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRR1Q13601 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRR1Q13601 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRR1Q13601 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRR1Q13601 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRR1Q13601 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRR1Q13601 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRR1Q13601 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRR1Q13601 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRR1Q13601 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
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