Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R1AQ13522 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1AQ13522 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1AQ13522 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R1AQ13522 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R1AQ13522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R1AQ13522 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R1AQ13522 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R1AQ13522 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R1AQ13522 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R1AQ13522 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1AQ13522 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1R1AQ13522 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R1AQ13522 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R1AQ13522 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R1AQ13522 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R1AQ13522 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R1AQ13522 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R1AQ13522 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R1AQ13522 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R1AQ13522 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R1AQ13522 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R1AQ13522 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP1R1AQ13522 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP1R1AQ13522 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP1R1AQ13522 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R1AQ13522 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R1AQ13522 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R1AQ13522 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R1AQ13522 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R1AQ13522 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R1AQ13522 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R1AQ13522 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R1AQ13522 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R1AQ13522 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R1AQ13522 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R1AQ13522 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R1AQ13522 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R1AQ13522 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R1AQ13522 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R1AQ13522 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R1AQ13522 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R1AQ13522 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R1AQ13522 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R1AQ13522 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R1AQ13522 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R1AQ13522 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R1AQ13522 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R1AQ13522 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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