Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP1R1AQ13522 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R1AQ13522 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1AQ13522 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1AQ13522 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R1AQ13522 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1AQ13522 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R1AQ13522 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R1AQ13522 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R1AQ13522 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R1AQ13522 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1R1AQ13522 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPP1R1AQ13522 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R1AQ13522 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1AQ13522 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R1AQ13522 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R1AQ13522 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R1AQ13522 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP1R1AQ13522 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP1R1AQ13522 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R1AQ13522 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R1AQ13522 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R1AQ13522 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R1AQ13522 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R1AQ13522 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R1AQ13522 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP1R1AQ13522 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R1AQ13522 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R1AQ13522 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R1AQ13522 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R1AQ13522 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R1AQ13522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R1AQ13522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R1AQ13522 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R1AQ13522 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R1AQ13522 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R1AQ13522 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R1AQ13522 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R1AQ13522 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R1AQ13522 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R1AQ13522 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R1AQ13522 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R1AQ13522 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R1AQ13522 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R1AQ13522 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R1AQ13522 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R1AQ13522 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R1AQ13522 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R1AQ13522 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1AQ13522 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1AQ13522 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1AQ13522 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1AQ13522 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1AQ13522 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R1AQ13522 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R1AQ13522 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1R1AQ13522 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP1R1AQ13522 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP1R1AQ13522 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R1AQ13522 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R1AQ13522 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R1AQ13522 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R1AQ13522 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R1AQ13522 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R1AQ13522 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R1AQ13522 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R1AQ13522 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R1AQ13522 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1AQ13522 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R1AQ13522 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1AQ13522 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1AQ13522 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1AQ13522 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R1AQ13522 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R1AQ13522 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R1AQ13522 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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