Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
XRCC4Q13426 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XRCC4Q13426 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XRCC4Q13426 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XRCC4Q13426 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XRCC4Q13426 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XRCC4Q13426 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XRCC4Q13426 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XRCC4Q13426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XRCC4Q13426 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XRCC4Q13426 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC4Q13426 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XRCC4Q13426 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XRCC4Q13426 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XRCC4Q13426 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XRCC4Q13426 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XRCC4Q13426 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
XRCC4Q13426 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XRCC4Q13426 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XRCC4Q13426 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
XRCC4Q13426 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
XRCC4Q13426 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC4Q13426 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC4Q13426 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
XRCC4Q13426 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XRCC4Q13426 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XRCC4Q13426 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XRCC4Q13426 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XRCC4Q13426 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XRCC4Q13426 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XRCC4Q13426 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XRCC4Q13426 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XRCC4Q13426 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
XRCC4Q13426 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XRCC4Q13426 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XRCC4Q13426 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XRCC4Q13426 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XRCC4Q13426 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XRCC4Q13426 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XRCC4Q13426 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XRCC4Q13426 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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