Protein–RNA interactions for Protein: P63098

PPP3R1, Calcineurin subunit B type 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3R1P63098 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP3R1P63098 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP3R1P63098 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP3R1P63098 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPP3R1P63098 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPP3R1P63098 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3R1P63098 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3R1P63098 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3R1P63098 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3R1P63098 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3R1P63098 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3R1P63098 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3R1P63098 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP3R1P63098 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3R1P63098 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP3R1P63098 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3R1P63098 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP3R1P63098 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP3R1P63098 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3R1P63098 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3R1P63098 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3R1P63098 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3R1P63098 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3R1P63098 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3R1P63098 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3R1P63098 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3R1P63098 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP3R1P63098 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP3R1P63098 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP3R1P63098 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP3R1P63098 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP3R1P63098 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP3R1P63098 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP3R1P63098 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP3R1P63098 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3R1P63098 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3R1P63098 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3R1P63098 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3R1P63098 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP3R1P63098 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3R1P63098 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP3R1P63098 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3R1P63098 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3R1P63098 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP3R1P63098 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP3R1P63098 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3R1P63098 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3R1P63098 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3R1P63098 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3R1P63098 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3R1P63098 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3R1P63098 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3R1P63098 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms