Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN12P56749 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN12P56749 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN12P56749 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN12P56749 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN12P56749 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN12P56749 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN12P56749 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN12P56749 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN12P56749 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN12P56749 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN12P56749 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN12P56749 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN12P56749 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN12P56749 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN12P56749 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN12P56749 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN12P56749 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN12P56749 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN12P56749 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN12P56749 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN12P56749 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN12P56749 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN12P56749 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN12P56749 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN12P56749 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN12P56749 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN12P56749 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN12P56749 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN12P56749 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN12P56749 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN12P56749 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN12P56749 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN12P56749 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN12P56749 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN12P56749 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN12P56749 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN12P56749 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN12P56749 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN12P56749 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN12P56749 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN12P56749 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms