Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1B3P54709 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B3P54709 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B3P54709 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1B3P54709 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1B3P54709 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1B3P54709 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1B3P54709 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1B3P54709 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1B3P54709 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1B3P54709 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B3P54709 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1B3P54709 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B3P54709 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1B3P54709 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1B3P54709 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1B3P54709 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1B3P54709 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1B3P54709 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1B3P54709 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1B3P54709 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1B3P54709 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B3P54709 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B3P54709 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B3P54709 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1B3P54709 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1B3P54709 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP1B3P54709 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1B3P54709 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1B3P54709 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1B3P54709 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1B3P54709 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1B3P54709 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1B3P54709 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1B3P54709 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1B3P54709 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1B3P54709 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1B3P54709 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1B3P54709 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1B3P54709 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1B3P54709 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1B3P54709 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1B3P54709 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms