Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PMS2P54278 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PMS2P54278 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PMS2P54278 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PMS2P54278 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PMS2P54278 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PMS2P54278 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PMS2P54278 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PMS2P54278 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PMS2P54278 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PMS2P54278 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PMS2P54278 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PMS2P54278 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PMS2P54278 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PMS2P54278 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PMS2P54278 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PMS2P54278 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PMS2P54278 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PMS2P54278 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PMS2P54278 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PMS2P54278 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PMS2P54278 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PMS2P54278 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PMS2P54278 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PMS2P54278 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PMS2P54278 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PMS2P54278 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PMS2P54278 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PMS2P54278 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PMS2P54278 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PMS2P54278 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PMS2P54278 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PMS2P54278 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PMS2P54278 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PMS2P54278 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PMS2P54278 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMS2P54278 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMS2P54278 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMS2P54278 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PMS2P54278 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PMS2P54278 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PMS2P54278 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMS2P54278 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMS2P54278 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PMS2P54278 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PMS2P54278 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PMS2P54278 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PMS2P54278 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PMS2P54278 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PMS2P54278 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PMS2P54278 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PMS2P54278 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PMS2P54278 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PMS2P54278 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PMS2P54278 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PMS2P54278 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PMS2P54278 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PMS2P54278 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PMS2P54278 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PMS2P54278 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PMS2P54278 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PMS2P54278 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PMS2P54278 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PMS2P54278 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PMS2P54278 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PMS2P54278 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PMS2P54278 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMS2P54278 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMS2P54278 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PMS2P54278 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PMS2P54278 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PMS2P54278 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PMS2P54278 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMS2P54278 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMS2P54278 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PMS2P54278 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PMS2P54278 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMS2P54278 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMS2P54278 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMS2P54278 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMS2P54278 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMS2P54278 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMS2P54278 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PMS2P54278 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PMS2P54278 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PMS2P54278 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PMS2P54278 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PMS2P54278 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PMS2P54278 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PMS2P54278 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PMS2P54278 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PMS2P54278 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PMS2P54278 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMS2P54278 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PMS2P54278 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS2P54278 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS2P54278 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS2P54278 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS2P54278 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PMS2P54278 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms