Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGA2P52926 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGA2P52926 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGA2P52926 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGA2P52926 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGA2P52926 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGA2P52926 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGA2P52926 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGA2P52926 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGA2P52926 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGA2P52926 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGA2P52926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGA2P52926 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGA2P52926 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGA2P52926 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HMGA2P52926 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGA2P52926 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGA2P52926 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGA2P52926 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA2P52926 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMGA2P52926 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMGA2P52926 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGA2P52926 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGA2P52926 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGA2P52926 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGA2P52926 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGA2P52926 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGA2P52926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGA2P52926 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms