Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB5CP51148 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB5CP51148 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB5CP51148 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB5CP51148 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB5CP51148 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB5CP51148 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB5CP51148 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB5CP51148 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB5CP51148 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB5CP51148 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB5CP51148 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB5CP51148 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB5CP51148 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB5CP51148 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB5CP51148 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB5CP51148 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB5CP51148 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB5CP51148 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB5CP51148 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB5CP51148 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB5CP51148 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB5CP51148 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB5CP51148 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB5CP51148 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB5CP51148 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB5CP51148 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB5CP51148 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB5CP51148 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB5CP51148 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB5CP51148 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB5CP51148 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB5CP51148 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB5CP51148 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB5CP51148 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB5CP51148 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB5CP51148 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB5CP51148 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB5CP51148 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB5CP51148 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB5CP51148 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB5CP51148 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB5CP51148 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms