Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB5CP51148 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB5CP51148 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB5CP51148 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB5CP51148 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB5CP51148 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB5CP51148 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB5CP51148 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB5CP51148 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB5CP51148 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB5CP51148 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB5CP51148 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB5CP51148 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB5CP51148 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB5CP51148 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB5CP51148 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB5CP51148 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB5CP51148 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB5CP51148 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB5CP51148 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB5CP51148 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB5CP51148 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB5CP51148 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB5CP51148 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB5CP51148 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB5CP51148 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB5CP51148 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB5CP51148 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB5CP51148 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB5CP51148 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB5CP51148 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB5CP51148 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB5CP51148 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB5CP51148 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB5CP51148 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB5CP51148 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB5CP51148 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB5CP51148 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB5CP51148 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB5CP51148 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB5CP51148 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB5CP51148 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB5CP51148 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB5CP51148 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB5CP51148 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB5CP51148 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB5CP51148 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB5CP51148 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB5CP51148 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB5CP51148 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB5CP51148 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB5CP51148 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB5CP51148 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB5CP51148 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB5CP51148 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB5CP51148 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB5CP51148 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB5CP51148 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB5CP51148 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB5CP51148 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB5CP51148 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB5CP51148 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB5CP51148 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB5CP51148 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB5CP51148 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB5CP51148 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB5CP51148 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB5CP51148 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB5CP51148 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB5CP51148 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB5CP51148 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB5CP51148 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB5CP51148 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB5CP51148 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB5CP51148 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB5CP51148 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB5CP51148 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB5CP51148 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB5CP51148 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB5CP51148 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB5CP51148 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB5CP51148 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB5CP51148 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms