Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL28P46779 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL28P46779 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL28P46779 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL28P46779 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL28P46779 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL28P46779 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL28P46779 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL28P46779 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL28P46779 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL28P46779 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL28P46779 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL28P46779 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL28P46779 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL28P46779 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL28P46779 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL28P46779 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL28P46779 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL28P46779 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL28P46779 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL28P46779 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL28P46779 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL28P46779 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL28P46779 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL28P46779 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL28P46779 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL28P46779 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL28P46779 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL28P46779 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL28P46779 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL28P46779 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL28P46779 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL28P46779 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL28P46779 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL28P46779 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL28P46779 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL28P46779 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL28P46779 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL28P46779 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL28P46779 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL28P46779 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL28P46779 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL28P46779 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL28P46779 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL28P46779 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL28P46779 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL28P46779 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL28P46779 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL28P46779 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL28P46779 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL28P46779 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL28P46779 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL28P46779 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL28P46779 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL28P46779 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL28P46779 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL28P46779 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL28P46779 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL28P46779 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL28P46779 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL28P46779 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL28P46779 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL28P46779 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL28P46779 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL28P46779 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL28P46779 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL28P46779 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL28P46779 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL28P46779 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL28P46779 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL28P46779 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL28P46779 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL28P46779 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL28P46779 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL28P46779 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL28P46779 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL28P46779 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL28P46779 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL28P46779 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL28P46779 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL28P46779 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL28P46779 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL28P46779 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL28P46779 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL28P46779 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL28P46779 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL28P46779 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL28P46779 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL28P46779 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL28P46779 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL28P46779 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL28P46779 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL28P46779 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms