Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1E1P36543 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1E1P36543 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1E1P36543 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1E1P36543 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V1E1P36543 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1E1P36543 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1E1P36543 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1E1P36543 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E1P36543 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E1P36543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E1P36543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1E1P36543 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1E1P36543 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1E1P36543 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1E1P36543 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V1E1P36543 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1E1P36543 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1E1P36543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V1E1P36543 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP6V1E1P36543 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1E1P36543 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E1P36543 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E1P36543 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E1P36543 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E1P36543 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V1E1P36543 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1E1P36543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1E1P36543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E1P36543 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E1P36543 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6V1E1P36543 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP6V1E1P36543 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1E1P36543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1E1P36543 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1E1P36543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E1P36543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1E1P36543 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1E1P36543 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP6V1E1P36543 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms