Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THBS2P35442 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THBS2P35442 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THBS2P35442 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THBS2P35442 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THBS2P35442 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THBS2P35442 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THBS2P35442 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THBS2P35442 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THBS2P35442 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THBS2P35442 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THBS2P35442 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THBS2P35442 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THBS2P35442 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THBS2P35442 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THBS2P35442 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THBS2P35442 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THBS2P35442 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THBS2P35442 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THBS2P35442 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THBS2P35442 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THBS2P35442 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THBS2P35442 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THBS2P35442 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THBS2P35442 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THBS2P35442 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THBS2P35442 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THBS2P35442 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THBS2P35442 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THBS2P35442 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THBS2P35442 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THBS2P35442 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THBS2P35442 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THBS2P35442 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THBS2P35442 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THBS2P35442 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THBS2P35442 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THBS2P35442 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THBS2P35442 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THBS2P35442 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THBS2P35442 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THBS2P35442 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THBS2P35442 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THBS2P35442 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THBS2P35442 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
THBS2P35442 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THBS2P35442 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THBS2P35442 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THBS2P35442 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THBS2P35442 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THBS2P35442 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THBS2P35442 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THBS2P35442 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THBS2P35442 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THBS2P35442 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THBS2P35442 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THBS2P35442 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THBS2P35442 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THBS2P35442 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THBS2P35442 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THBS2P35442 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THBS2P35442 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THBS2P35442 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
THBS2P35442 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THBS2P35442 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THBS2P35442 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THBS2P35442 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THBS2P35442 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THBS2P35442 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THBS2P35442 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THBS2P35442 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THBS2P35442 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THBS2P35442 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THBS2P35442 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THBS2P35442 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THBS2P35442 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THBS2P35442 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THBS2P35442 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THBS2P35442 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THBS2P35442 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THBS2P35442 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THBS2P35442 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THBS2P35442 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THBS2P35442 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THBS2P35442 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THBS2P35442 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THBS2P35442 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THBS2P35442 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THBS2P35442 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THBS2P35442 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THBS2P35442 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THBS2P35442 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THBS2P35442 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THBS2P35442 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THBS2P35442 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THBS2P35442 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THBS2P35442 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THBS2P35442 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THBS2P35442 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THBS2P35442 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms