Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC2P34741 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC2P34741 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDC2P34741 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC2P34741 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDC2P34741 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDC2P34741 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDC2P34741 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDC2P34741 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDC2P34741 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDC2P34741 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDC2P34741 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDC2P34741 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDC2P34741 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDC2P34741 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDC2P34741 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDC2P34741 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDC2P34741 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDC2P34741 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDC2P34741 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDC2P34741 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDC2P34741 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SDC2P34741 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDC2P34741 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDC2P34741 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDC2P34741 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDC2P34741 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDC2P34741 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDC2P34741 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDC2P34741 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDC2P34741 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDC2P34741 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDC2P34741 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDC2P34741 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDC2P34741 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDC2P34741 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDC2P34741 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDC2P34741 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDC2P34741 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDC2P34741 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDC2P34741 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDC2P34741 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDC2P34741 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDC2P34741 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDC2P34741 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDC2P34741 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDC2P34741 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDC2P34741 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDC2P34741 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDC2P34741 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDC2P34741 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDC2P34741 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDC2P34741 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDC2P34741 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDC2P34741 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDC2P34741 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDC2P34741 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDC2P34741 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDC2P34741 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDC2P34741 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDC2P34741 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDC2P34741 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDC2P34741 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDC2P34741 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDC2P34741 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDC2P34741 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDC2P34741 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDC2P34741 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDC2P34741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDC2P34741 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDC2P34741 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDC2P34741 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDC2P34741 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDC2P34741 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDC2P34741 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDC2P34741 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDC2P34741 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDC2P34741 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDC2P34741 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDC2P34741 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDC2P34741 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDC2P34741 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDC2P34741 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDC2P34741 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDC2P34741 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDC2P34741 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC2P34741 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC2P34741 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC2P34741 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC2P34741 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC2P34741 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC2P34741 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC2P34741 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC2P34741 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC2P34741 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC2P34741 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC2P34741 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC2P34741 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC2P34741 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC2P34741 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms