Protein–RNA interactions for Protein: P0CG48

UBC, Polyubiquitin-C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBCP0CG48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBCP0CG48 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBCP0CG48 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBCP0CG48 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBCP0CG48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBCP0CG48 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBCP0CG48 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBCP0CG48 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBCP0CG48 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBCP0CG48 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBCP0CG48 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBCP0CG48 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBCP0CG48 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBCP0CG48 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBCP0CG48 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBCP0CG48 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBCP0CG48 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBCP0CG48 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBCP0CG48 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBCP0CG48 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBCP0CG48 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBCP0CG48 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBCP0CG48 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBCP0CG48 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBCP0CG48 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBCP0CG48 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBCP0CG48 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBCP0CG48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBCP0CG48 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBCP0CG48 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBCP0CG48 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBCP0CG48 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBCP0CG48 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBCP0CG48 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBCP0CG48 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBCP0CG48 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBCP0CG48 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBCP0CG48 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBCP0CG48 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBCP0CG48 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBCP0CG48 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBCP0CG48 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBCP0CG48 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBCP0CG48 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBCP0CG48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBCP0CG48 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBCP0CG48 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBCP0CG48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBCP0CG48 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms