Protein–RNA interactions for Protein: P04432

IGKV1D-39, Immunoglobulin kappa variable 1D-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-39P04432 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1D-39P04432 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGKV1D-39P04432 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-39P04432 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV1D-39P04432 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1D-39P04432 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV1D-39P04432 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1D-39P04432 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1D-39P04432 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV1D-39P04432 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV1D-39P04432 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1D-39P04432 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1D-39P04432 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGKV1D-39P04432 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGKV1D-39P04432 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGKV1D-39P04432 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV1D-39P04432 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV1D-39P04432 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV1D-39P04432 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1D-39P04432 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1D-39P04432 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGKV1D-39P04432 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1D-39P04432 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-39P04432 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-39P04432 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-39P04432 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-39P04432 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-39P04432 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-39P04432 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1D-39P04432 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1D-39P04432 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-39P04432 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms