Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
E2F6O75461 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F6O75461 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F6O75461 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F6O75461 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F6O75461 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F6O75461 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F6O75461 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F6O75461 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F6O75461 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F6O75461 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F6O75461 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F6O75461 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F6O75461 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F6O75461 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F6O75461 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F6O75461 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
E2F6O75461 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F6O75461 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F6O75461 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F6O75461 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F6O75461 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F6O75461 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F6O75461 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F6O75461 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F6O75461 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F6O75461 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F6O75461 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E2F6O75461 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F6O75461 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F6O75461 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F6O75461 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F6O75461 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F6O75461 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F6O75461 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F6O75461 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F6O75461 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F6O75461 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F6O75461 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F6O75461 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F6O75461 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F6O75461 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F6O75461 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F6O75461 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F6O75461 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F6O75461 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F6O75461 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F6O75461 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F6O75461 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F6O75461 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F6O75461 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F6O75461 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F6O75461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F6O75461 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F6O75461 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F6O75461 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F6O75461 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F6O75461 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F6O75461 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F6O75461 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F6O75461 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F6O75461 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F6O75461 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F6O75461 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F6O75461 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F6O75461 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F6O75461 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F6O75461 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F6O75461 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F6O75461 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F6O75461 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F6O75461 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F6O75461 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F6O75461 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F6O75461 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F6O75461 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F6O75461 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F6O75461 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F6O75461 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F6O75461 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F6O75461 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F6O75461 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F6O75461 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F6O75461 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F6O75461 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F6O75461 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F6O75461 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F6O75461 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F6O75461 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F6O75461 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F6O75461 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F6O75461 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F6O75461 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F6O75461 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F6O75461 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F6O75461 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F6O75461 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F6O75461 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F6O75461 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F6O75461 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms