Protein–RNA interactions for Protein: O75409

HYPM, Huntingtin-interacting protein M, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPMO75409 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HYPMO75409 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HYPMO75409 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HYPMO75409 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HYPMO75409 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HYPMO75409 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HYPMO75409 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HYPMO75409 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HYPMO75409 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HYPMO75409 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HYPMO75409 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HYPMO75409 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HYPMO75409 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HYPMO75409 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HYPMO75409 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HYPMO75409 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HYPMO75409 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HYPMO75409 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HYPMO75409 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HYPMO75409 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HYPMO75409 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HYPMO75409 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HYPMO75409 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HYPMO75409 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPMO75409 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPMO75409 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPMO75409 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPMO75409 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPMO75409 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPMO75409 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPMO75409 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HYPMO75409 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HYPMO75409 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HYPMO75409 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HYPMO75409 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HYPMO75409 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPMO75409 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPMO75409 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPMO75409 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPMO75409 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HYPMO75409 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HYPMO75409 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HYPMO75409 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HYPMO75409 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HYPMO75409 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HYPMO75409 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HYPMO75409 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HYPMO75409 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HYPMO75409 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HYPMO75409 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HYPMO75409 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HYPMO75409 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HYPMO75409 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HYPMO75409 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HYPMO75409 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HYPMO75409 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HYPMO75409 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HYPMO75409 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HYPMO75409 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HYPMO75409 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HYPMO75409 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HYPMO75409 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HYPMO75409 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HYPMO75409 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HYPMO75409 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HYPMO75409 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HYPMO75409 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HYPMO75409 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HYPMO75409 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HYPMO75409 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HYPMO75409 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HYPMO75409 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HYPMO75409 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HYPMO75409 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HYPMO75409 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HYPMO75409 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HYPMO75409 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HYPMO75409 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HYPMO75409 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HYPMO75409 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HYPMO75409 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HYPMO75409 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HYPMO75409 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HYPMO75409 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HYPMO75409 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HYPMO75409 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HYPMO75409 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HYPMO75409 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HYPMO75409 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HYPMO75409 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HYPMO75409 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HYPMO75409 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HYPMO75409 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HYPMO75409 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HYPMO75409 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HYPMO75409 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HYPMO75409 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HYPMO75409 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HYPMO75409 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HYPMO75409 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms