Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARPC1BO15143 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARPC1BO15143 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARPC1BO15143 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARPC1BO15143 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARPC1BO15143 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARPC1BO15143 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARPC1BO15143 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARPC1BO15143 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARPC1BO15143 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARPC1BO15143 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARPC1BO15143 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARPC1BO15143 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC1BO15143 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC1BO15143 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARPC1BO15143 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARPC1BO15143 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARPC1BO15143 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARPC1BO15143 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARPC1BO15143 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARPC1BO15143 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARPC1BO15143 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARPC1BO15143 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARPC1BO15143 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARPC1BO15143 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARPC1BO15143 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARPC1BO15143 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARPC1BO15143 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC1BO15143 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARPC1BO15143 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARPC1BO15143 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARPC1BO15143 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARPC1BO15143 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARPC1BO15143 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARPC1BO15143 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARPC1BO15143 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARPC1BO15143 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARPC1BO15143 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARPC1BO15143 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARPC1BO15143 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARPC1BO15143 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARPC1BO15143 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARPC1BO15143 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARPC1BO15143 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARPC1BO15143 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARPC1BO15143 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARPC1BO15143 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARPC1BO15143 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms