Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINE3A8MV23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINE3A8MV23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINE3A8MV23 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINE3A8MV23 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINE3A8MV23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINE3A8MV23 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINE3A8MV23 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINE3A8MV23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINE3A8MV23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINE3A8MV23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINE3A8MV23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERPINE3A8MV23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINE3A8MV23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINE3A8MV23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINE3A8MV23 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINE3A8MV23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINE3A8MV23 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINE3A8MV23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINE3A8MV23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINE3A8MV23 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINE3A8MV23 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINE3A8MV23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINE3A8MV23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINE3A8MV23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINE3A8MV23 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINE3A8MV23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms