Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB19A4D1S5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB19A4D1S5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB19A4D1S5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB19A4D1S5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB19A4D1S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB19A4D1S5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB19A4D1S5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB19A4D1S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB19A4D1S5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB19A4D1S5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB19A4D1S5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB19A4D1S5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB19A4D1S5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB19A4D1S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB19A4D1S5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB19A4D1S5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB19A4D1S5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB19A4D1S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB19A4D1S5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB19A4D1S5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB19A4D1S5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB19A4D1S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB19A4D1S5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB19A4D1S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB19A4D1S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB19A4D1S5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB19A4D1S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB19A4D1S5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB19A4D1S5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB19A4D1S5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB19A4D1S5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB19A4D1S5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms