Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC189A1A4V9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC189A1A4V9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC189A1A4V9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC189A1A4V9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC189A1A4V9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC189A1A4V9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC189A1A4V9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC189A1A4V9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC189A1A4V9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC189A1A4V9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC189A1A4V9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC189A1A4V9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC189A1A4V9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC189A1A4V9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC189A1A4V9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC189A1A4V9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC189A1A4V9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC189A1A4V9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC189A1A4V9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC189A1A4V9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC189A1A4V9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC189A1A4V9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC189A1A4V9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC189A1A4V9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC189A1A4V9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC189A1A4V9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC189A1A4V9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC189A1A4V9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC189A1A4V9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC189A1A4V9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC189A1A4V9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC189A1A4V9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC189A1A4V9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC189A1A4V9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC189A1A4V9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC189A1A4V9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC189A1A4V9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC189A1A4V9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC189A1A4V9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC189A1A4V9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC189A1A4V9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC189A1A4V9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC189A1A4V9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC189A1A4V9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC189A1A4V9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC189A1A4V9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC189A1A4V9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC189A1A4V9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC189A1A4V9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC189A1A4V9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms