Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVI7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVI7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVI7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVI7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVI7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVI7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1B0GVI7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1B0GVI7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVI7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A1B0GVI7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1B0GVI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVI7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GVI7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVI7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVI7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GVI7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GVI7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GVI7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GVI7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A1B0GVI7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GVI7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GVI7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GVI7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GVI7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GVI7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GVI7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GVI7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1B0GVI7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms