Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1D8

TRBV6-1, T-cell receptor beta variable 6-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-1A0A0K0K1D8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-1A0A0K0K1D8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-1A0A0K0K1D8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-1A0A0K0K1D8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV6-1A0A0K0K1D8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV6-1A0A0K0K1D8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV6-1A0A0K0K1D8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms