Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1D8

TRBV6-1, T-cell receptor beta variable 6-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRBV6-1A0A0K0K1D8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV6-1A0A0K0K1D8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV6-1A0A0K0K1D8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV6-1A0A0K0K1D8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV6-1A0A0K0K1D8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV6-1A0A0K0K1D8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV6-1A0A0K0K1D8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV6-1A0A0K0K1D8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV6-1A0A0K0K1D8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV6-1A0A0K0K1D8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV6-1A0A0K0K1D8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-1A0A0K0K1D8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-1A0A0K0K1D8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV6-1A0A0K0K1D8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV6-1A0A0K0K1D8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-1A0A0K0K1D8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV6-1A0A0K0K1D8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-1A0A0K0K1D8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-1A0A0K0K1D8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-1A0A0K0K1D8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-1A0A0K0K1D8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms