Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV2-40A0A087WW87 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV2-40A0A087WW87 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV2-40A0A087WW87 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV2-40A0A087WW87 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV2-40A0A087WW87 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV2-40A0A087WW87 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV2-40A0A087WW87 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV2-40A0A087WW87 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV2-40A0A087WW87 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGKV2-40A0A087WW87 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV2-40A0A087WW87 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV2-40A0A087WW87 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV2-40A0A087WW87 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV2-40A0A087WW87 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV2-40A0A087WW87 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV2-40A0A087WW87 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV2-40A0A087WW87 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV2-40A0A087WW87 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV2-40A0A087WW87 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV2-40A0A087WW87 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV2-40A0A087WW87 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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