Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 314.48□□□□□ -0.098e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.415e-46■□□□□ 9
ILF3Q12906 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.385e-46■□□□□ 9
ILF3Q12906 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.982e-22■□□□□ 9
ILF3Q12906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.632e-7■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-206ENST00000402641 669 ntTSL 318.45■□□□□ 0.543e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 414.14□□□□□ -0.153e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.922e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.572e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSBP3-210ENST00000525990 701 ntTSL 211.99□□□□□ -0.492e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 39.52□□□□□ -0.892e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 PLOD1-205ENST00000465920 871 ntTSL 512.06□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 321.43■■□□□ 1.022e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 517.73■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 NFIC-208ENST00000589537 977 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.192e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 316.07■□□□□ 0.162e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 ADGRL1-206ENST00000591528 612 ntTSL 212.73□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-205ENST00000577483 1630 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.392e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-203ENST00000394848 1796 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.482e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-207ENST00000578411 633 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-208ENST00000579040 965 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.572e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 SMIM7-216ENST00000598278 603 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SMIM7-206ENST00000465250 1281 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 9
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ILF3Q12906 AC008764.4-206ENST00000594509 479 ntTSL 29.65□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SMIM7-211ENST00000593409 1757 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SMIM7-207ENST00000481671 1126 ntTSL 29.45□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SMIM7-213ENST00000594662 1076 ntTSL 29.2□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-209ENST00000579954 428 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.033e-7■□□□□ 9
ILF3Q12906 AC008764.4-201ENST00000593962 468 ntTSL 28.59□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 AC008764.4-205ENST00000593459 222 ntAPPRIS P1 TSL 38.11□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 KIF2C-206ENST00000472235 480 ntTSL 27.67□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SMIM7-215ENST00000597781 975 ntTSL 27.55□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 AC008764.4-202ENST00000601636 437 ntTSL 36.83□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.442e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.453e-7■□□□□ 9
ILF3Q12906 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.522e-8■□□□□ 9
ILF3Q12906 AC008764.4-203ENST00000593991 548 ntTSL 25.08□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 9
ILF3Q12906 ASXL2-204ENST00000497092 549 ntTSL 24□□□□□ -1.773e-7■□□□□ 9
ILF3Q12906 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-9■□□□□ 9
ILF3Q12906 SAE1-211ENST00000600753 483 ntTSL 421.15■□□□□ 0.983e-7■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 SAE1-208ENST00000597808 570 ntTSL 217.76■□□□□ 0.433e-7■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.053e-7■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 HS1BP3-206ENST00000446825 841 ntTSL 314.53□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 SAE1-206ENST00000594526 709 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 CBR4-207ENST00000510042 1198 ntTSL 211.76□□□□□ -0.533e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 CBR4-206ENST00000509108 546 ntTSL 33.02□□□□□ -1.933e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-220ENST00000549686 563 ntTSL 217.02■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-230ENST00000551477 1186 ntTSL 316.88■□□□□ 0.291e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-202ENST00000380135 1566 ntTSL 315.96■□□□□ 0.141e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-210ENST00000547555 1658 ntTSL 515.78■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-212ENST00000547877 2020 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-218ENST00000549340 818 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-209ENST00000547318 2001 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-222ENST00000550274 809 ntTSL 212.57□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-231ENST00000551931 705 ntTSL 312.57□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 PPP2R5E-207ENST00000556878 3371 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.516e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-221ENST00000550100 1480 ntTSL 211.69□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 HDLBP-235ENST00000476807 1070 ntTSL 511.36□□□□□ -0.596e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-234ENST00000552645 1623 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-217ENST00000548516 850 ntTSL 59.36□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-228ENST00000550929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-219ENST00000549395 475 ntTSL 37.54□□□□□ -1.21e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-204ENST00000546814 894 ntTSL 26.73□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-208ENST00000547256 618 ntTSL 26.71□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-236ENST00000553043 727 ntTSL 26.71□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-207ENST00000547029 455 ntTSL 45.79□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-211ENST00000547660 601 ntTSL 44.83□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 LETMD1-227ENST00000550814 565 ntTSL 44.82□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 SRP54-207ENST00000555535 552 ntTSL 43.42□□□□□ -1.866e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 PAFAH1B1-210ENST00000575477 694 ntTSL 517.36■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 PAFAH1B1-211ENST00000576586 557 ntTSL 416.34■□□□□ 0.211e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.031e-8■□□□□ 8.9
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