RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262055.8

LETMD1-201, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LETMD1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-201ENST00000262055 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.01■■■■□ 3.03
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LETMD1-201ENST00000262055 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.97■■■□□ 2.07
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LETMD1-201ENST00000262055 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.98■■□□□ 1.75
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LETMD1-201ENST00000262055 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.83■■□□□ 1.57
LETMD1-201ENST00000262055 ABCC8Q09428 1581 aa24.77■■□□□ 1.56
LETMD1-201ENST00000262055 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.74■■□□□ 1.55
LETMD1-201ENST00000262055 ERCC6Q03468 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
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LETMD1-201ENST00000262055 SYNJ1O43426 1573 aa24.6■■□□□ 1.53
LETMD1-201ENST00000262055 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
LETMD1-201ENST00000262055 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.59■■□□□ 1.53
LETMD1-201ENST00000262055 TOPBP1Q92547 1522 aa24.54■■□□□ 1.52
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LETMD1-201ENST00000262055 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
LETMD1-201ENST00000262055 WDR62O43379 1518 aa24.52■■□□□ 1.52
LETMD1-201ENST00000262055 TOP2BQ02880 1626 aa24.51■■□□□ 1.51
LETMD1-201ENST00000262055 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.51■■□□□ 1.51
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LETMD1-201ENST00000262055 WDR97A6NE52 1622 aa24.22■■□□□ 1.47
LETMD1-201ENST00000262055 IFT140Q96RY7 1462 aa24.18■■□□□ 1.46
LETMD1-201ENST00000262055 HRCP23327 699 aa24.16■■□□□ 1.46
LETMD1-201ENST00000262055 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.16■■□□□ 1.46
LETMD1-201ENST00000262055 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
LETMD1-201ENST00000262055 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.13■■□□□ 1.45
LETMD1-201ENST00000262055 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
LETMD1-201ENST00000262055 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
LETMD1-201ENST00000262055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.06■■□□□ 1.44
LETMD1-201ENST00000262055 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 12.7
LETMD1-201ENST00000262055 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LETMD1-201ENST00000262055 KIF27Q86VH2 1401 aa24■■□□□ 1.43
LETMD1-201ENST00000262055 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.99■■□□□ 1.43
LETMD1-201ENST00000262055 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
LETMD1-201ENST00000262055 PBRM1Q86U86 1689 aa23.97■■□□□ 1.43
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LETMD1-201ENST00000262055 ADAMTS12P58397 1594 aa23.78■■□□□ 1.4
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LETMD1-201ENST00000262055 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
LETMD1-201ENST00000262055 CHD1O14646 1710 aa23.68■■□□□ 1.38
LETMD1-201ENST00000262055 KIF21BO75037 1637 aa23.68■■□□□ 1.38
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LETMD1-201ENST00000262055 FBLN2P98095 1184 aa23.62■■□□□ 1.37
LETMD1-201ENST00000262055 GRIN2AQ12879 1464 aa23.61■■□□□ 1.37
LETMD1-201ENST00000262055 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.6■■□□□ 1.37
LETMD1-201ENST00000262055 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
LETMD1-201ENST00000262055 GOLGA3Q08378 1498 aa23.55■■□□□ 1.36
LETMD1-201ENST00000262055 CEP170Q5SW79 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
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