Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.51e-28■■■■■ 92.7
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ILF3Q12906 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 512.55□□□□□ -0.41e-28■■■■■ 92.7
ILF3Q12906 GPBP1-209ENST00000515484 962 ntTSL 24.32□□□□□ -1.727e-22■■■■■ 75.5
ILF3Q12906 GPBP1-202ENST00000309096 1385 ntTSL 24.31□□□□□ -1.727e-22■■■■■ 75.5
ILF3Q12906 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.917e-22■■■■■ 75.5
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ILF3Q12906 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-16■■■■■ 73.3
ILF3Q12906 C20orf96-201ENST00000360321 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-16■■■■■ 73.3
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ILF3Q12906 LINC01146-202ENST00000553929 413 ntTSL 33.9□□□□□ -1.793e-8■■■■■ 72.1
ILF3Q12906 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.031e-22■■■■■ 70.7
ILF3Q12906 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.565e-8■■■■■ 65.2
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ILF3Q12906 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 511.83□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 64.5
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ILF3Q12906 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-14■■■■■ 61
ILF3Q12906 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-14■■■■■ 61
ILF3Q12906 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.362e-14■■■■■ 61
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ILF3Q12906 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-7■■■■■ 59.3
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ILF3Q12906 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 59.3
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ILF3Q12906 RSBN1L-206ENST00000468035 585 ntTSL 34.78□□□□□ -1.641e-12■■■■■ 58.2
ILF3Q12906 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.327e-16■■■■■ 55.8
ILF3Q12906 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.287e-16■■■■■ 55.8
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ILF3Q12906 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-14■■■■■ 55.7
ILF3Q12906 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 35.07□□□□□ -1.61e-14■■■■■ 55.7
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ILF3Q12906 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.783e-8■■■■■ 53.3
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ILF3Q12906 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 52.3
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ILF3Q12906 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 52.3
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ILF3Q12906 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-13■■■■■ 51.9
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ILF3Q12906 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 51.3
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ILF3Q12906 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.453e-8■■■■■ 50.5
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ILF3Q12906 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-13■■■■■ 50.1
ILF3Q12906 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.675e-13■■■■■ 50.1
ILF3Q12906 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.925e-13■■■■■ 50.1
ILF3Q12906 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.887e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 419.45■□□□□ 0.77e-15■■■■■ 49.7
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ILF3Q12906 ZNF148-208ENST00000495019 763 ntTSL 518.46■□□□□ 0.557e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 215.36■□□□□ 0.057e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -07e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.527e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.97e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 ZNF148-202ENST00000465763 566 ntTSL 47.91□□□□□ -1.147e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.217e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.277e-15■■■■■ 49.7
ILF3Q12906 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.933e-13■■■■■ 49.5
ILF3Q12906 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 415.96■□□□□ 0.153e-13■■■■■ 49.5
ILF3Q12906 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-13■■■■■ 49.5
ILF3Q12906 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.383e-13■■■■■ 49.5
ILF3Q12906 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 222.15■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 49.1
ILF3Q12906 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 221.04■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 49.1
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