RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614794.4

SPPL2B-211, Transcript of signal peptide peptidase like 2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPPL2B, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2B-211ENST00000614794 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.91■■■■■ 6.06
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SPPL2B-211ENST00000614794 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.8■■■■■ 4.6
SPPL2B-211ENST00000614794 NACADO15069 1562 aa43.77■■■■■ 4.6
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SPPL2B-211ENST00000614794 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.64■■■■■ 4.58
SPPL2B-211ENST00000614794 SCRIBQ14160 1630 aa42.68■■■■■ 4.42
SPPL2B-211ENST00000614794 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.6■■■■■ 4.41
SPPL2B-211ENST00000614794 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.28■■■■■ 4.36
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SPPL2B-211ENST00000614794 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
SPPL2B-211ENST00000614794 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.13■■■■■ 4.18
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SPPL2B-211ENST00000614794 SMARCA4P51532 1647 aa40.88■■■■■ 4.13
SPPL2B-211ENST00000614794 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.78■■■■■ 4.12
SPPL2B-211ENST00000614794 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.77■■■■■ 4.12
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SPPL2B-211ENST00000614794 SMARCA2P51531 1590 aa40.51■■■■■ 4.07
SPPL2B-211ENST00000614794 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.48■■■■■ 4.07
SPPL2B-211ENST00000614794 NCAPD3P42695 1498 aa40.4■■■■■ 4.06
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SPPL2B-211ENST00000614794 HMGXB3Q12766 1538 aa40.24■■■■■ 4.03
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SPPL2B-211ENST00000614794 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.2■■■■□ 3.87
SPPL2B-211ENST00000614794 NESP48681 1621 aa39.19■■■■□ 3.86
SPPL2B-211ENST00000614794 CFTRP13569 1480 aa39.17■■■■□ 3.86
SPPL2B-211ENST00000614794 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.95■■■■□ 3.83
SPPL2B-211ENST00000614794 PRDM2Q13029 1718 aa38.85■■■■□ 3.81
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SPPL2B-211ENST00000614794 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.8■■■■□ 3.8
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.71■■■■□ 3.79
SPPL2B-211ENST00000614794 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.68■■■■□ 3.78
SPPL2B-211ENST00000614794 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.48■■■■□ 3.75
SPPL2B-211ENST00000614794 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
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SPPL2B-211ENST00000614794 ABCC8Q09428 1581 aa38.32■■■■□ 3.72
SPPL2B-211ENST00000614794 WDR62O43379 1518 aa38.31■■■■□ 3.72
SPPL2B-211ENST00000614794 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.725e-6■■■□□ 14.6
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SPPL2B-211ENST00000614794 TOPBP1Q92547 1522 aa38.25■■■■□ 3.71
SPPL2B-211ENST00000614794 CUX1P39880 1505 aa38.21■■■■□ 3.71
SPPL2B-211ENST00000614794 CUX2O14529 1486 aa38.13■■■■□ 3.69
SPPL2B-211ENST00000614794 SYNJ1O43426 1573 aa38.08■■■■□ 3.69
SPPL2B-211ENST00000614794 TOP2BQ02880 1626 aa38.07■■■■□ 3.68
SPPL2B-211ENST00000614794 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.03■■■■□ 3.68
SPPL2B-211ENST00000614794 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.98■■■■□ 3.67
SPPL2B-211ENST00000614794 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
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SPPL2B-211ENST00000614794 IFT140Q96RY7 1462 aa37.86■■■■□ 3.65
SPPL2B-211ENST00000614794 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.85■■■■□ 3.65
SPPL2B-211ENST00000614794 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.81■■■■□ 3.64
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SPPL2B-211ENST00000614794 WDR97A6NE52 1622 aa37.58■■■■□ 3.61
SPPL2B-211ENST00000614794 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
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SPPL2B-211ENST00000614794 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.41■■■■□ 3.58
SPPL2B-211ENST00000614794 GRIN2BQ13224 1484 aa37.33■■■■□ 3.57
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SPPL2B-211ENST00000614794 PBRM1Q86U86 1689 aa37.23■■■■□ 3.55
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SPPL2B-211ENST00000614794 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.16■■■■□ 3.54
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SPPL2B-211ENST00000614794 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
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SPPL2B-211ENST00000614794 CHD1O14646 1710 aa36.85■■■■□ 3.49
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SPPL2B-211ENST00000614794 KIF21BO75037 1637 aa36.67■■■■□ 3.46
SPPL2B-211ENST00000614794 NUP160Q12769 1436 aa36.64■■■■□ 3.46
SPPL2B-211ENST00000614794 CEP170Q5SW79 1584 aa36.59■■■■□ 3.45
SPPL2B-211ENST00000614794 GOLGA3Q08378 1498 aa36.55■■■■□ 3.44
SPPL2B-211ENST00000614794 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.52■■■■□ 3.44
SPPL2B-211ENST00000614794 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.48■■■■□ 3.43
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